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Filtro BCH para Validação Pós-MAFFT na Detecção de SNPs do SARS-CoV-2

Marcelo A. C. Fernandes
Códigos BCHfiltragem genômicaMAFFTSARS-CoV-2

Resumo

Este trabalho propõe o uso de códigos BCH como filtro algébrico de validação pós-alinhamento para detecção de mutações pontuais (SNPs) na proteína Spike do SARS-CoV-2. As sequências provêm do banco GISAID, onde são alinhadas contra a referência pelo MAFFT, um método heurístico baseado em FFT que não garante alinhamento exato como algoritmos de programação dinâmica. O decodificador BCH atua como segunda camada de controle de qualidade, verificando se o padrão de diferenças entre cada sequência e a referência é compatível com o modelo de Canal Binário Simétrico (BSC), rejeitando sequências cujo alinhamento pode ter falhado silenciosamente. O método dispensa limiares \textit{a priori} de qualidade, delegando ao filtro BCH a rejeição de sequências com densidade de erros excessiva. Resultados sobre 95.322 sequências das variantes Alpha e Delta demonstram recall médio de 0,988, confirmando os SNPs canônicos. O parâmetro estimado do BSC, \(\hat{p} \approx 1{,}3 \times 10^{-3}\), é estável entre códigos e distinto entre variantes, sugerindo seu uso como assinatura de canal.